Arbeitsgruppe

Medizinische Bild- und Signalverarbeitung - gemeinsame Arbeitsgruppe des Fachbereiches Med. Informatik und Med. Bioinformatik und Systembiologie

PhD projects in Research Training Group BIOQIC

Charité - Universitätsmedizin, PTB, FU Berlin, TU Berlin

The BIOQIC research program will advance medical imaging methods towards the system-independent quantification of the constitution and structure of soft tissues including vascular components, multiscale fluid motility as well as mechanical parameters. Scientific training will include the quantitative analysis of image parameters related to biophysics and tissue structure over a wide range of spatial scales, from microscopic structures to macroscopic representation, measured by innovative imaging approaches.

Contact: bioqic@charite.de

More Infomations: https://bioqic.de/available-phd-projects-from-april-2023/

Ziele der Arbeitsgruppe

Die Arbeitsgruppe Medizinische Bild- und Signalverarbeitung der GMDS ist zugleich ein Arbeitskreis der Gesellschaft für Informatik (GI) im Fachbereich Informatik in den Lebenswissenschaften.

Die AG versteht sich als Plattform für alle aktiven Institute und Arbeitsgruppen im Bereich der Medizinischen Bild- und Signalverarbeitung. Ziel ist die Stärkung dieser Themen innerhalb der Medizinischen Informatik, insbesondere innerhalb der Fachgesellschaften GMDS und GI. Dabei soll vor allem der Austausch von innovativen Forschungsansätzen unterstützt und die Ausbildung von Nachwuchskräften strukturell gefördert werden.

Leistungen:

  • Zentrale Übersicht einer Vielzahl von Forschergruppen im Bereich der Medizinischen Bild- und Signalverarbeitung (mit Schwerpunkt deutschsprachiger Raum)
  • Kommunikation über den BVM Newsletter
  • Themenspezifische Stellenangebote
  • Regelmäßige Treffen (2 x jährlich: BVM und GMDS Jahrestagung)
Wer? Was? Wo?

 Forschungs- und Anwendergruppen im deutschsprachigen Raum stellen sich vor

Stellenangebote

 Stellenangebote speziell für den Themenbereich der Medizinischen Bild- und Signalverarbeitung

Veranstaltungen

 Veranstaltungen der AG (Workshops, Konferenzen,...)  sowie Veranstaltungshinweise der Mitglieder

Tätigkeiten der Arbeitsgruppe

Die AG organisiert den jährlichen Workshop Bildverarbeitung für die Medizin (BVM) mit, der dem Austausch von Forschungsergebnissen und dem Networking mit Fokus auf der Medizinischen Bildverarbeitung dient. Insbesondere unterstützt die AG das überregionale BVM-Komitee bei der Erstellung des monatlichen Newsletters.

Darüber hinaus wird der Workshop Biomedical Image and Signal Computing (BISC) in 2 bis 3 jährlichen Rhythmus in Kooperation mit der Fachgruppe Biosignale der DGBMT organisiert. Die BISC findet im Rahmen der GMDS Jahrestagung oder der BMT Tagung statt und dient dem  Austausch und der Zusammenarbeit der Bildverarbeitung und der Signalverarbeitung. Darüber hinaus beteiligt sich die AG an weiteren Workshops in Form von Mitarbeit in Programmkomitees, etc.

Neben der Workshop-Organisation stellt die AG auf dieser Webseite Informationen für alle Interessierten der Medizinischen Bild- und Signalverarbeitung zusammen. Zum einen stellen sich Forschungs- und Anwendergruppen vor, zum anderen werden themenspezifische Stellenangebote gesammelt.

Die AG trifft sich 2x im Jahr:

  • auf dem BVM Workshop
  • auf der GMDS Jahrestagung

Zur Kommunikation innerhalb der AG gibt es eine Mailingliste. Hier kann sich jede(r) Interessierte auch selbst ein- und austragen:
Senden Sie eine Email ohne Betreff mit dem Text subscribe gmds-ag-mbv bzw. unsubscribe gmds-ag-mbv an majordomo@iis.fraunhofer.de.

Archiv der Tätigkeitsberichte

  • AKTIVITÄTEN IM JAHR 2022

    AKTIVITÄTEN IM JAHR 2022

    Tätigkeit vom 1. Januar 2022 bis 31. Dezember 2022

    Die Arbeitsgruppe Medizinische Bild- und Signalverarbeitung der GMDS, kurz GMDS-AG-MBSV, ist auch Arbeitskreis der GI (GI-AK-MBSV) im Fachbereich Informatik in den Lebenswissenschaften (FB ILW). Innerhalb der GMDS ist die AG nicht nur dem Fachausschuss „Medizinische Informatik“, sondern auch dem Fachausschuss „Medizinische Bioinformatik und Systembiologie“ zugehörig. Die AG besteht aus rund 15 aktiven und circa 40 passiven Mitgliedern, die überwiegend im akademischen Umfeld beschäftigt sind und von ihrem Hintergrund der GMDS zuzurechnen sind. Die Tätigkeiten der AG umfassen die Mitarbeit bei der Organisation von Workshops, Publikationen, Web-Präsenz (http://mbsv.gmds.de) und Informationsangebote sowie die Veranstaltung regelmäßiger Treffen.

    1.    Arbeitsgruppentreffen

    Üblicherweise finden zweimal im Jahr regelmäßige Arbeitsgruppentreffen statt. Traditionell trifft sich die AG auf dem Workshop Bildverarbeitung für die Medizin (BVM) und auf der GMDS Jahrestagung. Aufgrund der Pandemie wurden beide Treffen auch 22 virtuell als Videokonferenz abgehalten. Das Treffen im Rahmen der BVM fand am 27.06.2022 statt. Das nächste reguläre Treffen fand am 07.11.2022 statt.  

    2.    Workshops und Aktivitäten

    An den Workshops „Bildverarbeitung für die Medizin“ (http://bvm-workshop.org) nehmen seit mehreren Jahren 120-180 Kolleginnen und Kollegen teil, davon rund 90 aktiv mit wissenschaftlichen Beiträgen oder als Organisatoren und Moderatoren. Der Workshop „Bildverarbeitung für die Medizin“ – BVM 2022 wurde im Juni 2022 hybrid am Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ), (Tagungsleitung Prof. Dr. Klaus H. Maier-Hein) abgehalten. Dabei wurden die Beiträge der Autorinnen und Autoren wie bereits im Vorjahr auf einem Youtube-Kanal gesammelt und allen zur Verfügung gestellt. Die Proceedings der BVM sind wie immer in der Springer-Reihe Informatik Aktuell erschienen (https://link.springer.com/book/10.1007/978-3-658-36932-3). Neben der finanziellen und organisatorischen Unterstützung der BVM gestaltet die AG auch den BVM Newsletter maßgeblich mit.

    In Zusammenarbeit mit dem Fachausschuss Biosignale der DGBMT wurde von der AG erneut eine Mini-Workshopserie zum Thema „Risikoprädiktion von kardiovaskulären Erkrankungen mittels signal- und bildbasierter Verfahren“ durchgeführt. Aufgrund der kurzfristigen Absage aller Workshops bei der GMDS-Jahrestagung aufgrund der Online-Umstellung fand der geplante Workshop am 20.10.2022 virtuell statt und hatte den Schwerpunkt bildbasierte Verfahren. Der Workshop auf der BMT 2022 fand am 29.9.22 in Präsenz statt und hatte den Schwerpunkt biosignalbasierte Verfahren.

    3.   Kommunikation

    Die Landkarte der aktiven Gruppen wurde auf der Website der GMDS auf OpenStreetMap umgestellt. Für die kurzfristige Kommunikation wurde eine Chatgruppe auf Signal erstellt.

    4.    Vorgesehene Aktivitäten 2023

    Der Workshop „Bildverarbeitung für die Medizin“ – BVM 2023 wird vom 2. bis 4. Juli 2023 aktuell in Präsenz geplant, unter der Leitung von Prof. Thomas Deserno (PLRI - Peter L Reichertz Institut) stattfinden. Darüber hinaus soll der Beitrag zum GMDS-Channel noch einmal angegeben werden, ebenso planen wir wieder eine Mini-Workshopserie GMDS/DBGMT 2023.

    5.    Amtszeit der Arbeitsgruppenleitung und dessen Vertretung: 30. September 2020  - 29. September 2023

  • AKTIVITÄTEN IM JAHR 2021

    AKTIVITÄTEN IM JAHR 2021

    Tätigkeit vom 1. Januar 2021 bis 31. Dezember 2021

    Die Arbeitsgruppe Medizinische Bild- und Signalverarbeitung der GMDS, kurz GMDS-AG-MBSV, ist auch Arbeitskreis der GI (GI-AK-MBSV) im Fachbereich Informatik in den Lebenswissenschaften (FB ILW). Innerhalb der GMDS ist die AG nicht nur dem Fachausschuss „Medizinische Informatik“, sondern auch dem Fachausschuss „Medizinische Bioinformatik und Systembiologie“ zugehörig. Die AG besteht aus rund 15 aktiven und circa 40 passiven Mitgliedern, die überwiegend im akademischen Umfeld beschäftigt sind und von ihrem Hintergrund der GMDS zuzurechnen sind. Die Tätigkeiten der AG umfassen die Mitarbeit bei der Organisation von Workshops, Publikationen, Web-Präsenz (http://mbsv.gmds.de) und Informationsangebote sowie die Veranstaltung regelmäßiger Treffen.

    1.    Arbeitsgruppentreffen

    Üblicherweise finden zweimal im Jahr regelmäßige Arbeitsgruppentreffen statt. Traditionell trifft sich die AG auf dem Workshop Bildverarbeitung für die Medizin (BVM) und auf der GMDS Jahrestagung. Aufgrund der Pandemie wurden beide Treffen virtuell als Videokonferenz abgehalten. Das Treffen im Rahmen der BVM fand am 8.3.2021 statt. Das nächste reguläre Treffen fand am 22.10.2020 statt.  

    2.    Workshops und Aktivitäten

    An den Workshops „Bildverarbeitung für die Medizin“ (http://bvm-workshop.org) nehmen seit mehreren Jahren 120-180 Kolleginnen und Kollegen teil, davon rund 90 aktiv mit wissenschaftlichen Beiträgen oder als Organisatoren und Moderatoren. Der Workshop „Bildverarbeitung für die Medizin“ – BVM 2021 wurde im März 2021 virtuell an der Ostbayrischen Hochschule Regensburg (Tagungsleitung Prof. Christoph Palm) abgehalten. Dabei wurden die Beiträge der Autorinnen und Autoren wie bereits im Vorjahr auf einem Youtube-Kanal gesammelt und allen zur Verfügung gestellt. Die Proceedings der BVM sind wie immer in der Springer-Reihe Informatik Aktuell erschienen (https://doi.org/10.1007/978-3-658-33198-6). Neben der finanziellen und organisatorischen Unterstützung der BVM gestaltet die AG auch den BVM Newsletter maßgeblich mit.

    In Zusammenarbeit mit dem Fachausschuss Biosignale der DGBMT wurde von der AG eine Mini-Workshopserie zum Thema „Blutdruck, Hämodynamik und Gefäßzustand: Innovative Erfassung und Bewertung“ durchgeführt. Der Workshop auf der GMDS-Jahrestagung fand am Mittwoch, den 29.09.2021, virtuell statt und hatte den Schwerpunkt bildbasierte Verfahren. Der Workshop auf der BMT 2021 fand am Mittwoch, den 6.10.2021 in Präsenz statt und hatte den Schwerpunkt biosignalbasierte Verfahren.

    3.    Vorgesehene Aktivitäten 2022

    Der Workshop „Bildverarbeitung für die Medizin“ – BVM 2022 ist für März 2022 je nach aktueller Pandemielage hybrid oder virtuell unter der Leitung von Prof. Klaus Maier-Hein (DKFZ Heidelberg) geplant. Darüber hinaus ist ein Beitrag zum GMDS-Channel über die AG sowie ein Workshop auf der GMDS 2022 in Vorbereitung. Darüber hinaus soll die  die interne und externe Kommunikation aktualisiert werden.

    4.    Amtszeit der Arbeitsgruppenleitung und dessen Vertretung: 30. September 2020  - 29. September 2023

  • AKTIVITÄTEN IM JAHR 2020

    AKTIVITÄTEN IM JAHR 2020

    Tätigkeit vom 1. Januar 2020 bis 31. Dezember 2020

    Die Arbeitsgruppe Medizinische Bild- und Signalverarbeitung der GMDS, kurz GMDS-AG-MBSV, ist auch Ar- beitskreis der GI (GI-AK-MBSV) im Fachbereich Informatik in den Lebenswissenschaften (FB ILW). Innerhalb der GMDS ist die AG nicht nur dem Fachausschuss „Medizinische Informatik“, sondern auch dem Fachausschuss „Medizinische Bioinformatik und Systembiologie“ zugehörig. Die AG besteht aus rund 15 aktiven und circa 40 passiven Mitgliedern, die überwiegend im akademischen Umfeld beschäftigt sind und von ihrem Hintergrund der GMDS zuzurechnen sind. Die Tätigkeiten der AG umfassen die Mitarbeit bei der Organisation von Workshops, Publikationen, Web-Präsenz (http://mbsv.gmds.de) und Informationsangebote sowie die Veranstaltung regelmäßiger Treffen.

    1.   Arbeitsgruppentreffen
    Üblicherweise finden zweimal im Jahr regelmäßige Arbeitsgruppentreffen statt. Traditionell trifft sich die AG auf dem Workshop Bildverarbeitung für die Medizin (BVM) und auf der GMDS Jahrestagung. Aufgrund der Pandemie wurde das für den 15.3.2020 geplante Treffen kurzfristig am 14.3.2020 abgesagt. Das nächste reguläre Treffen fand am 30.9.2020 virtuell als Videokonferenz statt.  Dort wurde auch die AG-Leitung turnusmäßig neu gewählt.
     

    2.   Workshops und Aktivitäten
    An den Workshops „Bildverarbeitung für die Medizin“ (http://bvm-workshop.org) nehmen seit mehreren Jahren 120-180 Kolleginnen und Kollegen teil, davon rund 90 aktiv mit wissenschaftlichen Beiträgen oder als Organisatoren und Moderatoren. Der Workshop „Bildverarbeitung für die Medizin“ – BVM 2020 war für März 2020 in Berlin (Tagungsleitung Prof. Thomas Tolxdorff) geplant. Wenige Tage vor dem Start musste allerdings der Präsenzworkshop aufgrund der Corona-Pandemie in einen Video-Workshop umgewandelt werden. Dabei wurden die Beiträge der Autorinnen und Autoren auf einem Youtube-Kanal gesammelt und allen zur Verfügung gestellt. Die Proceedings der BVM sind wie immer in der Springer-Reihe Informatik Aktuell erschienen (https://doi.org/10.1007/978-3-658-29267-6). Neben der finanziellen und organisatorischen Unterstützung der BVM gestaltet die AG auch den BVM Newsletter maßgeblich mit.

    3.   Vorgesehene Aktivitäten 2021
    Der Workshop „Bildverarbeitung für die Medizin“ – BVM 2021 ist für März 2021 je nach aktueller Pandemielage hybrid oder virtuell unter der Leitung von Prof. Christoph Palm (OTH Regensburg) geplant. Darüber hinaus ist ein Beitrag zum GMDS-Channel über die AG sowie ein Workshop auf der GMDS 2021 in Vorbereitung. Darüber hinaus soll die Webseite sowie die interne und externe Kommunikation aktualisiert und ein Konzept zur Nachwuchsförderung entwickelt werden.

  • AKTIVITÄTEN IM JAHR 2019

    AKTIVITÄTEN IM JAHR 2019

    Tätigkeit vom 1. Januar 2019 bis 31. Dezember 2019

    Die Arbeitsgruppe Medizinische Bild- und Signalverarbeitung der GMDS, kurz GMDS-AG-MBSV, ist auch Arbeitskreis der GI (GI-AK-MBSV) im Fachbereich Informatik in den Lebenswissenschaften (FB ILW). Innerhalb der GMDS ist die AG seit diesem Jahr nicht nur dem Fachausschuss „Medizinische Informatik“, sondern auch dem Fachausschuss „Medizinische Bioinformatik und Systembiologie“ zugehörig.

    Die AG besteht aus rund 15 aktiven und circa 40 passiven Mitgliedern, die überwiegend im akademischen Umfeld beschäftigt sind und von Ihrem Hintergrund der GMDS zuzurechnen sind. Die Tätigkeiten der AG umfassen die Mitarbeit bei der Organisation von Workshops, Publikationen, Web-Präsenz (http://mbsv.gmds.de) und Informationsangebot, sowie die Veranstaltung regelmäßiger Treffen.

    1.  Arbeitsgruppentreffen

    Zweimal im Jahr finden regelmäßige Arbeitsgruppentreffen statt. Traditionell trifft sich die AG auf dem Workshop Bildverarbeitung für die Medizin (BVM) und auf der GMDS Jahrestagung. In diesem Jahr fanden die Treffen im März auf der BVM in Lübeck und im September auf der GMDS Jahrestagung in Dortmund.

    2. Workshops und Aktivitäten

    An den Workshops „Bildverarbeitung für die Medizin“ (http://bvm-workshop.org) nehmen seit mehreren Jahren 120-180 Kolleginnen und Kollegen teil, davon rund 90 aktiv mit wissenschaftlichen Beiträgen oder als Organisatoren und Moderatoren. Im Jahr 2019 fand der Workshop bei Prof. Dr. Heinz Handels von der Universität zu Lübeck statt. Die Proceedings der BVM sind wie immer in der Springer-Reihe Informatik Aktuell erschienen (https://doi.org/10.1007/978-3-658-25326-4). Zusätzlich wurden die besten Beiträge zu einem Special Issue der Zeitschrift International Journal for Computer Assisted Radiology and Surgery (IJCARS) eingeladen. Dieses Special Issue ist im November 2019 erschienen (https://doi.org/10.1007/s11548-019-02086-x). Neben der finanziellen und organisatorischen Unterstützung der BVM gestaltet die AG auch den BVM Newsletter maßgeblich mit.

    Darüber hinaus wurde auf der GMDS Jahrestagung in Dortmund der Workshop „Deep Learning in der Medizinischen Informatik und der Bioinformatik“ in Kooperation mit der Projektgruppe “KI in der Diagnostik“ des Fachausschusses „Medizinische Bioinformatik und Systembiologie“ ausgerichtet. Dabei konnte mit über 100 Teilnehmerinnen und Teilnehmern ein großes Interesse verzeichnet werden.

    3. Vorgesehen Aktivitäten 2020

    Der Workshop „Bildverarbeitung für die Medizin“ – BVM 2020 war für März 2020 in Berlin geplant. Wenige Tage vor dem Start musste allerdings der Präsenzworkshop aufgrund der Corona-Pandemie in einen Video-Workshop umgewandelt werden. Dabei wurden die Beiträge der Autorinnen und Autoren auf einem Youtube-Kanal gesammelt und allen zur Verfügung gestellt. Dadurch musste auch das in Berlin geplante AG Treffen abgesagt werden. Deshalb wird sich Arbeitsgruppe in 2020 erstmalig im September 2020 während der GMDS Jahrestagung in Berlin treffen. Dort wird auch die AG Leitung turnusmäßig neu gewählt.

  • Aktivitäten im Jahr 2017

    Aktivitäten im Jahr 2017

    Tätigkeit vom 1. Januar 2017 bis 31. Dezember 2017

    Die Arbeitsgruppe Medizinische Bild- und Signalverarbeitung der GMDS, kurz GMDS-AG-MBSV, ist auch Arbeitskreis der GI (GI-AK-MBSV) im Fachbereich Informatik in den Lebenswissenschaften (FB ILW). Die AG besteht aus rund 15 aktiven und circa 40 passiven Mitgliedern, die überwiegend im akademischen Umfeld beschäftigt sind und von Ihrem Hintergrund der GMDS zuzurechnen sind. Die Tätigkeiten der AG umfassen die Mitarbeit bei der Organisation von Workshops, Publikationen, Web-Präsenz (http://mbsv.gmds.de) und Informationsangebot, sowie die Veranstaltung regelmäßiger Treffen.

    1.  Arbeitsgruppentreffen

    Zweimal im Jahr finden regelmäßige Arbeitsgruppentreffen statt. Traditionell trifft sich die AG auf dem Workshop Bildverarbeitung für die Medizin (BVM) und auf der GMDS Jahrestagung. In diesem Jahr fanden die Treffen im März auf der BVM in Heidelberg und im September auf der GMDS Jahrestagung in Oldenburg. Dort wurde die AG-Leitung neu gewählt. Dabei wurden Prof. Dr. Dennis Säring von der FH Wedel zum stellvertretenden Leiter und Prof. Dr. Christoph Palm von der OTH Regensburg zum Leiter der AG gewählt.

     2. Workshops und Aktivitäten

    An den Workshops „Bildverarbeitung für die Medizin“ (http://bvm-workshop.org) nehmen seit mehreren Jahren 120-220 Kolleginnen und Kollegen teil, davon rund 100 aktiv mit wissenschaftlichen Beiträgen oder als Organisatoren und Moderatoren. In diesem Jahr fand der Workshop bei PD. Dr. Klaus Maier-Hein vom Deutschen Krebsforschungszentrum (DKFZ) Heidelberg statt. Nach dem Ausscheiden des jahrelangen Ausrichters der BVM in Heidelberg, Prof. Meinzer, ist damit die Nachfolge gelungen. Gleichzeitig wurde Prof. Dr. Andreas Meier von der FAU Erlangen und Prof. Dr. Christoph Palm von der OTH Regensburg neu in das überregionale Organisationskomitee aufgenommen. Die Proceedings der BVM sind wie immer in der Springer-Reihe Informatik Aktuell erschienen.

    Die Kooperation der GMDS-AG mit der BVM wurde gestärkt durch den BVM Newsletter, der Einzelmails über Stellenausschreibungen ersetzt und von der GMDS-AG maßgeblich mit gestaltet wird.

    3. Vorgesehen Aktivitäten 2018

    Der Workshop „Bildverarbeitung für die Medizin“ – BVM 2018 und das erste AG Treffen fanden bereits im März 2018 in Erlangen statt. Danach wird sich Arbeitsgruppe wieder im September 2018 während der GMDS Jahrestagung in Osnabrück treffen.

    Es wird angestrebt, ein Forum mit fachspezifischen Themen auf der Webseite der AG zu installieren, um den Mitgliedern mehr Gelegenheit zur Interaktion zu geben. Außerdem sollen die Vorbereitungen für einen dritten Workshop "Biomedical Image and Signal Computing" BISC starten, der im Jahr 2019 in Dortmund stattfinden könnte.